MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Streptococcus pneumoniae OXC141

Total Repeats: 8672

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017592	TAA	2	6	34	39	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017592	AAT	2	6	43	48	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017592	TTC	2	6	49	54	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_017592	ATT	2	6	96	101	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017592	CTAT	2	8	127	134	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
6	NC_017592	AGG	2	6	172	177	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017592	T	6	6	1566	1571	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017592	T	6	6	1575	1580	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017592	T	6	6	1588	1593	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017592	A	6	6	1603	1608	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017592	TAT	2	6	1657	1662	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017592	TAT	2	6	1666	1671	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017592	ATAA	2	8	1688	1695	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017592	AGT	2	6	2901	2906	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017592	TTAG	2	8	3108	3115	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017592	TGAAA	2	10	3159	3168	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017592	TAA	2	6	4305	4310	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017592	A	7	7	4330	4336	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017592	TCT	2	6	8457	8462	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_017592	AAT	2	6	8485	8490	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017592	TAA	2	6	8500	8505	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017592	GA	3	6	14322	14327	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017592	CT	3	6	14337	14342	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
24	NC_017592	T	6	6	14342	14347	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017592	A	8	8	14929	14936	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017592	A	7	7	14939	14945	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017592	AGT	2	6	14954	14959	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017592	AAC	2	6	15003	15008	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_017592	CGG	2	6	15049	15054	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_017592	TGA	2	6	15107	15112	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017592	A	7	7	15112	15118	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017592	A	7	7	15123	15129	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017592	A	6	6	15143	15148	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017592	GA	3	6	15197	15202	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017592	ACA	2	6	15259	15264	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_017592	GTA	2	6	15271	15276	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017592	A	7	7	15287	15293	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017592	GGC	2	6	15373	15378	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_017592	AGG	2	6	15408	15413	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017592	GCTT	2	8	15415	15422	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
41	NC_017592	CCTG	2	8	15463	15470	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
42	NC_017592	TGG	2	6	15592	15597	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017592	CGA	2	6	15616	15621	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_017592	GCA	2	6	15690	15695	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_017592	CGC	2	6	15737	15742	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
46	NC_017592	GTGA	2	8	15743	15750	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017592	TGT	2	6	15776	15781	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017592	AGA	2	6	15785	15790	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017592	CAG	2	6	15859	15864	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_017592	AGCG	2	8	15914	15921	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
51	NC_017592	TAG	2	6	15966	15971	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017592	AT	3	6	16043	16048	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017592	GGA	2	6	16049	16054	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017592	CT	3	6	16074	16079	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
55	NC_017592	GAA	2	6	16313	16318	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017592	GGT	2	6	16387	16392	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017592	GTC	2	6	16401	16406	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_017592	TCGTG	2	10	16410	16419	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
59	NC_017592	CAT	2	6	16469	16474	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_017592	TAA	2	6	16504	16509	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_017592	GGA	2	6	16513	16518	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
62	NC_017592	ATC	2	6	16537	16542	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_017592	AC	3	6	16564	16569	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
64	NC_017592	CGC	2	6	16703	16708	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
65	NC_017592	AC	3	6	16733	16738	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
66	NC_017592	CAC	2	6	16748	16753	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
67	NC_017592	AGCC	2	8	16795	16802	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
68	NC_017592	GAT	2	6	16818	16823	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
69	NC_017592	TAAGGA	2	12	16883	16894	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
70	NC_017592	AGG	2	6	16973	16978	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
71	NC_017592	GA	3	6	17011	17016	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
72	NC_017592	GTA	2	6	17088	17093	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017592	TAA	2	6	17095	17100	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_017592	GTTAA	2	10	17131	17140	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
75	NC_017592	CGA	2	6	17176	17181	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_017592	ACG	2	6	17194	17199	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_017592	GTAA	2	8	17217	17224	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
78	NC_017592	GAT	2	6	17227	17232	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
79	NC_017592	GTA	2	6	17264	17269	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
80	NC_017592	GAG	2	6	17297	17302	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
81	NC_017592	TAG	2	6	17365	17370	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
82	NC_017592	GCGA	2	8	17373	17380	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
83	NC_017592	AGA	2	6	17452	17457	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
84	NC_017592	AG	3	6	17480	17485	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
85	NC_017592	CGG	2	6	17536	17541	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_017592	GGA	2	6	17568	17573	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
87	NC_017592	GGGAG	2	10	17649	17658	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
88	NC_017592	ACA	2	6	17686	17691	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_017592	ATG	2	6	17753	17758	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
90	NC_017592	GGA	2	6	17886	17891	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
91	NC_017592	TC	3	6	17972	17977	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
92	NC_017592	ACC	2	6	18152	18157	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
93	NC_017592	AAT	2	6	18172	18177	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_017592	AGC	2	6	18232	18237	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_017592	ATTC	2	8	18239	18246	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
96	NC_017592	TG	3	6	18361	18366	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
97	NC_017592	GAG	2	6	18382	18387	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
98	NC_017592	GA	3	6	18512	18517	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
99	NC_017592	ACA	2	6	18538	18543	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_017592	CTAA	2	8	18593	18600	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
101	NC_017592	GTCT	2	8	18618	18625	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
102	NC_017592	TAG	2	6	18695	18700	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
103	NC_017592	GA	3	6	18808	18813	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
104	NC_017592	CT	3	6	18924	18929	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
105	NC_017592	GAT	2	6	18942	18947	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
106	NC_017592	CGG	2	6	19033	19038	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_017592	GA	3	6	19131	19136	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
108	NC_017592	TAGG	2	8	19249	19256	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
109	NC_017592	TAC	2	6	19303	19308	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_017592	CCT	2	6	19391	19396	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
111	NC_017592	GGT	2	6	19527	19532	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
112	NC_017592	TCG	2	6	19642	19647	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_017592	CGT	2	6	19722	19727	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_017592	AGGGA	2	10	19860	19869	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
115	NC_017592	TA	3	6	19926	19931	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_017592	GA	3	6	19946	19951	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
117	NC_017592	GAAGTG	2	12	19971	19982	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
118	NC_017592	ACTAAT	2	12	20001	20012	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
119	NC_017592	TTGAA	2	10	20064	20073	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
120	NC_017592	AGT	2	6	20180	20185	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
121	NC_017592	GTA	2	6	20247	20252	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
122	NC_017592	ATG	2	6	20270	20275	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
123	NC_017592	T	6	6	20329	20334	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_017592	TAA	3	9	20341	20349	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_017592	CTA	2	6	20461	20466	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_017592	TAT	2	6	20467	20472	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_017592	TG	3	6	20514	20519	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
128	NC_017592	TCC	2	6	20548	20553	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
129	NC_017592	TCTTGT	2	12	20657	20668	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
130	NC_017592	GAA	2	6	20728	20733	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
131	NC_017592	CTTT	2	8	20764	20771	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
132	NC_017592	T	6	6	20769	20774	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_017592	TGA	2	6	20822	20827	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
134	NC_017592	ATT	2	6	20829	20834	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_017592	GTG	2	6	20963	20968	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
136	NC_017592	TTA	2	6	21012	21017	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_017592	TTG	2	6	21077	21082	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
138	NC_017592	GAT	2	6	21130	21135	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
139	NC_017592	CATCTC	2	12	21202	21213	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
140	NC_017592	AGTTGA	2	12	21321	21332	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
141	NC_017592	TGA	2	6	21343	21348	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
142	NC_017592	TGA	2	6	21401	21406	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
143	NC_017592	TGA	2	6	21418	21423	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
144	NC_017592	TTC	2	6	21424	21429	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
145	NC_017592	AAG	2	6	21495	21500	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
146	NC_017592	T	7	7	21515	21521	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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149	NC_017592	TTG	2	6	21677	21682	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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151	NC_017592	A	6	6	21751	21756	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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295	NC_017592	AATA	2	8	63402	63409	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
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422	NC_017592	TAG	2	6	98062	98067	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
423	NC_017592	A	6	6	98078	98083	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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432	NC_017592	AGC	2	6	102907	102912	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
433	NC_017592	ATTCA	2	10	102946	102955	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
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435	NC_017592	TCCCAT	2	12	103017	103028	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
436	NC_017592	GTTT	2	8	104297	104304	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
437	NC_017592	GA	3	6	104309	104314	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
438	NC_017592	TTAAA	2	10	105393	105402	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
439	NC_017592	TGA	2	6	105421	105426	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
440	NC_017592	ATA	2	6	105435	105440	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
441	NC_017592	TAT	2	6	105448	105453	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
442	NC_017592	TTATC	2	10	105467	105476	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
443	NC_017592	TA	3	6	105528	105533	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
444	NC_017592	TAA	2	6	105541	105546	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
445	NC_017592	AAT	2	6	105548	105553	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
446	NC_017592	TAA	2	6	106446	106451	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
447	NC_017592	AAG	2	6	106532	106537	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
448	NC_017592	GAA	2	6	106555	106560	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
449	NC_017592	AAG	2	6	106905	106910	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
450	NC_017592	A	6	6	106915	106920	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
451	NC_017592	A	7	7	106932	106938	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
452	NC_017592	T	6	6	106983	106988	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
453	NC_017592	TAT	2	6	107039	107044	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
454	NC_017592	AGC	2	6	107156	107161	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
455	NC_017592	TCT	2	6	107213	107218	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
456	NC_017592	CTC	2	6	107242	107247	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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458	NC_017592	T	6	6	107688	107693	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
459	NC_017592	TCA	2	6	107701	107706	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
460	NC_017592	TCC	2	6	107710	107715	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
461	NC_017592	AGG	2	6	107757	107762	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
462	NC_017592	TATCA	2	10	108667	108676	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
463	NC_017592	TGA	2	6	108679	108684	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
464	NC_017592	T	6	6	108955	108960	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
465	NC_017592	T	6	6	109021	109026	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
466	NC_017592	TAG	2	6	109038	109043	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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468	NC_017592	T	6	6	111173	111178	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
469	NC_017592	TCT	2	6	111216	111221	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
470	NC_017592	TTC	2	6	111230	111235	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
471	NC_017592	GAAG	2	8	111261	111268	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
472	NC_017592	AG	4	8	111274	111281	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
473	NC_017592	A	6	6	111482	111487	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
474	NC_017592	GCA	2	6	111547	111552	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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477	NC_017592	TAGC	2	8	111662	111669	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
478	NC_017592	AGT	2	6	111768	111773	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
479	NC_017592	TGA	2	6	111780	111785	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
480	NC_017592	TGG	2	6	111787	111792	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
481	NC_017592	GATG	2	8	111854	111861	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
482	NC_017592	AAGG	2	8	111888	111895	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
483	NC_017592	AAG	2	6	111906	111911	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
484	NC_017592	AGTC	2	8	111925	111932	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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492	NC_017592	CAG	2	6	112389	112394	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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500	NC_017592	ATC	2	6	115310	115315	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding

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